در ابتدا لوله خروجی مخازن به پمپ دستگاه فیلتراسیون متصل می شود تا با مکش پمپ سوخت گازوئیل را به داخل دستگاه بکشاند و فرآیند تصفیه شروع شود . سیستم تصفیه سوخت با سه مرحله و سه فیلتر پاکسازی ذرات معلق، آب و آلایندگی ها را انجام می دهد تا سوخت باکیفیت تری برای سوختگیری ذخیره کند

• فیلتر ذرات 

سوخت به فیلتر ذرات میرسد که این فیلتر قادر است ذرات و آلایندگی ها مانند گرد و غبار و ذرات معلق جامد رو به اندازه بزرگی 30 میکرون و ذرات مایع تا 10 میکرون را از سوخت جدا و فیلتر می کند 
پس از آن که فیلتر ذرات جداسازی ذرات مضر و گرد و خاک را تا 30 میکرون انجام داد در ادامه روند تصفیه سوخت گازوئیل ، باید از فیلتر کوالسر عبور کند .

• فیلتر کوالسر

برای جداسازی ذرات آب از سوخت را انجام می دهد طبق آزمایش های انجام شده در آزمایشگاه اروند رهگستران پویا ، گازوئیل ایران ذرات معلق و درصد قطرات آب در آن بیش از جاهای دیگر است . فیلتر کوالسر جداسازی آب (به اختصار فیلتر آبگیر نیز گفته می شود ) از سوخت را انجام می دهد و آب جداسازی شده را در انتهای دستگاه فیلتراسیون گازوئیل جمع آوری می کند ( این دستگاه ها می توانند کنترل فشار اتوماتیک برای تخلیه آب را بدون اپراتور داشته باشند ) .

• فیلتر سپراتور 

این فیلتر در مرحله آخر تصفیه سوخت با دقت بالا، آخرین جداسازی های را بین سوخت با آب و هوا و ذرات معلق را انجام می دهد در این مرحله سوخت با کیفیت مطلوب تری خالص سازی می شود و می توان از طریق نازل های خروجی دستگاه سوخت گیری گازوئیل تصفیه شده توسط دستگاه فیلتراسیون گازوئیل اروند رهگستران پویا انجام شود و مراحل سوخت گیری انجام شود .